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世界最大規模のヒトタンパク質発現用クローンの提供開始
【バイオ】発信：2008/12/18(木) 16:37:58
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〜ポストゲノム研究の重要な研究資源、ＮＥＤＯ等が作製して提供〜
新エネルギー・産業技術総合開発機構（ＮＥＤＯ）は、約２万２０００個といわれるヒト全遺伝子のうち７０％程度に相当する約１万５０００種に対応する、世界最大規模のヒトタンパク質発現用クローンを作製して、希望する国内外の研究者等への提供を開始した。
これは「ヒトＧａｔｅｗａｙエントリークローン」と呼ばれる、タンパク質合成のための中心的なタンパク質発現リソースを提供するもので、タンパク質の相互作用研究、創薬につながる化合物スクリーニングへの利用、ｉＰＳ研究など、基礎から応用に至る幅広いポストゲノム研究に使える重要な研究資源である。産業技術総合研究所（産総研）、ＪＢｉＣ（社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム）および製品評価技術基盤機構（ＮＩＴＥ）等との共同研究成果であり、同クローンはＮＩＴＥから有料で入手できる。
今回は「ヒトＧａｔｅｗａｙエントリークローン」について、２万１４８５個のヒトｃＤＮＡ（ゲノムＤＮＡから不要な配列を除いたＤＮＡ）におけるＯＲＦ領域（タンパク質をコードしている遺伝子上のＤＮＡ領域）をＰＣＲで増幅し、ＧａｔｅｗａｙｐＤＯＮ２０１ドナーベクターと組換え、Ｎ型１万２７５４個とＦ型２万５２１個の総計３万３２７５個を作製した。
タンパク質の生産には、この「ヒトＧａｔｅｗａｙエントリークローン」をＧａｔｅｗａｙ発現ベクターと組換えをして、Ｇａｔｅｗａｙ発現クローンをつくり、そのクローンをもとにタンパク質合成する。
特に、インビトロ（生体外での）メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）作製の鋳型としたのが特徴であり、ＰＣＲで作ったＤＮＡ断片を鋳型としてｍＲＮＡを合成し、これをコムギ胚芽抽出液と混ぜてタンパク質を合成することができる。
これにより、ＤＮＡ組換えからタンパク質合成までの過程を全てインビトロで行えるようにし、ヒトの網羅的なタンパク質を簡便かつハイスループットに合成することが可能になった。 このようにして１万３３６４個の「ヒトＧａｔｅｗａｙエントリークローン」から、タンパク質合成を試みて合成効率を調べた結果では、程度の差はあるものの基本的に全てのタンパク質が合成されることを確認した。
作製した 「ヒトＧａｔｅｗａｙエントリークローン」は、ＮＩＴＥバイオテクノロジー本部生物遺伝資源部門から有料で入手できる。価格は１クローンについて、大学・教育機関・国公立試験研究機関の場合が１万５７５０円、民間試験研究機関が３万１５００円（いずれも税込）。また同クローンの情報が閲覧できるヒト遺伝子・タンパク質データベースのＷｅｂ公開も同時に開始した（URLまたはURL）。
また今回の研究成果の詳細は、科学雑誌Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｔｈｏｄｓ12月号に掲載された。（科学、12月5日号1面）
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